Créez des modèles 3D de protéines qui montrent comment la structure détermine la fonction
Demandez l'hémoglobine, une enzyme ou un anticorps dans n'importe quelle discussion, ou ouvrez votre chapitre de biochimie au format PDF. Vous obtenez un modèle légendé, avec ses hélices, ses feuillets et son site actif mis en évidence, prêt à être pivoté et zoomé dans la discussion ou sur sa propre page.
Bêta. Une génération complète par IA utilise 1 Crédit de création IA, après votre confirmation. Les petites modifications dans la discussion sont gratuites.
Réponse rapide
L'IA peut-elle créer un modèle 3D de protéine ?
Mis à jour en octobre 2026 · Les modèles 3D sont en bêta
Oui, sous la forme d'un modèle explicatif plutôt que d'une structure résolue. Posez votre question dans n'importe quelle discussion ou ouvrez votre PDF de biochimie, et l'IA de Scholarly écrit un modèle légendé des hélices alpha, des feuillets bêta, des domaines ou du site actif de la protéine. Il est conçu pour enseigner le fonctionnement de la protéine. Il n'est pas construit à partir de coordonnées expérimentales : utilisez donc PyMOL ou ChimeraX lorsque la position des atomes compte.
La fonction d'une protéine se comprend en 3D, et les niveaux de structure sont difficiles à relier à partir d'une simple liste. Une chaîne se replie en hélices et en feuillets, ceux-ci s'assemblent en un repliement tertiaire, et des sous-unités forment un ensemble comme l'hémoglobine. Voir la poche d'une enzyme, ou quatre sous-unités portant chacune un groupe hème, montre pourquoi un changement à un endroit peut avoir des effets ailleurs.
Choisissez la partie de l'histoire dont vous avez besoin. Demandez une seule région plutôt que chaque atome : le site actif d'une enzyme avec son substrat, la forme en Y d'un anticorps avec ses sites de liaison, ou un canal traversant une membrane. Créez le modèle à partir du chapitre de biochimie ou de l'article de synthèse sur lequel vous travaillez, au format PDF, et les légendes reprennent sa formulation sur la page dédiée du modèle. Ou posez votre question dans la discussion pendant votre lecture, et le modèle apparaît dans le fil.
Sachez ce que ce n'est pas. Scholarly ne lit pas les fichiers PDB ou CIF, n'utilise pas de coordonnées expérimentales et ne calcule ni ne prédit de structures. Les rubans et les poches sont illustratifs : n'utilisez donc pas un modèle pour des distances entre résidus, de l'amarrage moléculaire ou la conception de médicaments. Pour de vraies structures, utilisez PyMOL ou ChimeraX avec une entrée PDB, ou AlphaFold pour une structure prédite. Utilisez Scholarly lorsqu'il s'agit d'expliquer une protéine à une classe, un groupe de révision ou une équipe.
Fonctionnement
Comment créer un modèle de protéine
Nommez la protéine, choisissez la région qui compte et confirmez la création.
- 01
Demandez dans la discussion ou ouvrez votre chapitre
Demandez une protéine dans n'importe quelle discussion, ou lancez un modèle 3D à partir d'un chapitre de biochimie ou d'un article de synthèse enregistré au format PDF. Un modèle issu d'un PDF s'ouvre sur sa propre page.
- 02
Choisissez ce que le modèle doit enseigner
Indiquez la protéine et les éléments à légender : hélices, feuillets, site actif, domaine. Confirmez la création, qui utilise 1 crédit de création IA.
- 03
L'IA dessine le repliement
En quelques minutes, elle écrit le modèle en three.js, avec rubans, légendes et éclairage. La forme est illustrative, elle n'est pas calculée à partir de coordonnées.
- 04
Faites-le pivoter et changez ses couleurs
Faites-le pivoter et zoomez dans le message de la discussion, ou ouvrez-le en pleine page. Changez la couleur d'un domaine sur simple demande, et exportez pour une diapositive ou une vidéo avec un forfait payant.
Cas d'usage
Où les modèles de protéines sont utiles
Quand vous devez expliquer ce que fait une protéine, pas la mesurer.
Cours de biochimie
Les quatre niveaux de structure des protéines, de la chaîne d'acides aminés au complexe assemblé.
Enzymes
Un site actif avec son substrat, pour expliquer l'ajustement induit et l'inhibition compétitive.
Médecine et physiologie
Les sous-unités et les groupes hèmes de l'hémoglobine, ou la seule modification à l'origine de la drépanocytose.
Immunologie
Les chaînes lourdes et légères d'un anticorps et ses sites de liaison à l'antigène.
Formation en pharmacologie et biotechnologie
Un récepteur ou une kinase avec sa poche de liaison, pour expliquer un mécanisme d'action à une nouvelle recrue.
Révision du MCAT et des examens de médecine
Les structures à retenir, légendées avec les termes de vos propres supports de révision.
Exemples de demandes
Demandes à essayer sur les protéines
Nommez la protéine et les éléments à mettre en évidence.
Créez l'hémoglobine avec ses quatre sous-unités et ses groupes hèmes légendés.
Montrez une hélice alpha et un feuillet bêta côte à côte et légendez les liaisons hydrogène.
Modélisez une enzyme avec son site actif ouvert et un substrat sur le point de s'y lier.
Créez un anticorps IgG et légendez les chaînes lourdes, les chaînes légères et les sites de liaison à l'antigène.
Montrez un récepteur couplé aux protéines G traversant une membrane, avec ses sept hélices légendées.
Attribuez une couleur à chaque domaine et rendez l'arrière-plan transparent pour ma diapositive.
Bêta
Possibilités et limites actuelles
Les modèles 3D sont en version Bêta. Pour les protéines, cela signifie des modèles pédagogiques illustratifs, et non des structures issues de coordonnées expérimentales ou prédites.
Disponible aujourd'hui
- Modèles en rubans avec hélices alpha, feuillets bêta, domaines et sites actifs légendés.
- Vues explicatives d'une région, d'un complexe ou d'un mécanisme, plutôt que de chaque atome.
- Création dans n'importe quelle discussion avec affichage dans le message, ou à partir d'un PDF sur sa propre page.
- Avec un forfait payant, exportez un PNG 4K, un PNG transparent, un MP4 en rotation de 8 secondes en 1080p ou un fichier .glb.
Non pris en charge
- Ni la précision de la CAO ni celle requise en ingénierie. Les modèles expliquent un fonctionnement, ce ne sont pas des plans cotés.
- Pas d'export STL ou OBJ, ni d'impression 3D. Les exports comprennent des images, une vidéo de rotation du modèle et un fichier .glb.
- Pas d'outils de modification 3D manuelle : ni sculpture ni déplacement de pièces par glisser-déposer. Vous modifiez un modèle en le demandant dans la discussion.
- Un modèle se crée à partir d'un seul PDF ou d'une discussion vide. Pour des notes ou des diapositives, enregistrez-les au format PDF ou décrivez leur contenu dans la discussion.
- Il s'agit d'une bêta : prévisualisez chaque proposition avant de l'appliquer et vérifiez les légendes avant de présenter un modèle à une équipe.
FAQ
Questions fréquentes
Puis-je importer un fichier PDB ou CIF ?
Non. Un modèle 3D part d'un PDF ou d'une discussion vide, et ne lit pas les fichiers PDB, CIF ou autres fichiers de structure. Pour consulter une véritable entrée PDB, utilisez PyMOL ou ChimeraX.
Les positions et les distances des résidus sont-elles exactes ?
Non, et ce n'est pas leur but. Le modèle n'utilise pas de coordonnées expérimentales, et l'IA dispose les hélices, les feuillets et les poches pour illustrer la structure. Ne l'utilisez pas pour des mesures, de l'amarrage moléculaire ou de la conception.
Peut-il prédire la structure d'une protéine à partir d'une séquence ?
Non. Il ne calcule ni ne prédit le repliement. Pour une structure prédite, utilisez AlphaFold et visualisez le résultat dans ChimeraX. Un modèle Scholarly légendé peut ensuite vous aider à expliquer le rôle de cette structure.
Quel niveau de détail un modèle de protéine peut-il atteindre ?
Les modèles explicatifs sont les plus lisibles à l'échelle des hélices, des feuillets, des domaines et des sous-unités. Pour un grand complexe, demandez un seul domaine ou un seul site de liaison plutôt que chaque atome. Si une chaîne latérale précise compte, nommez-la et demandez une légende.
Peut-il montrer une protéine qui change de forme ?
Demandez-le lors de la création, par exemple l'hémoglobine qui passe de l'état T à l'état R et inversement, ou une enzyme qui se referme autour d'un substrat. Le mouvement est une animation écrite pour expliquer l'idée, pas une simulation de dynamique moléculaire. Ajouter une animation à un modèle existant compte comme une nouvelle création.
Combien coûte un modèle de protéine ?
Chaque création complète utilise 1 crédit de création IA, que vous confirmez au préalable, et une création échouée vous rend le crédit. Modifier une légende ou la couleur d'un domaine est une petite retouche qui n'utilise aucun crédit. Les exportations nécessitent un forfait payant.
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Bêta. Une génération complète par IA utilise 1 Crédit de création IA ; les petites modifications dans la discussion sont gratuites. Les exports nécessitent un forfait payant.