Loo 3D-valgumudeleid, mis näitavad, kuidas struktuur määrab funktsiooni
Palu mis tahes vestluses hemoglobiini, ensüümi või antikeha mudelit või ava oma biokeemiapeatükk PDF-ina. Saad siltidega mudeli, millel on esile toodud heeliksid, lehed ja aktiivtsenter ning mida saad kohe vestluses või eraldi lehel pöörata ja suumida.
Beeta. Täielik AI-ga loomine kasutab 1 AI-loomise krediiti ja nõuab eelnevat kinnitamist. Väikesed muudatused vestluses on tasuta.
Kiirvastus
Kas AI saab luua valgu 3D-mudeli?
Uuendatud oktoobris 2026 · 3D-mudelid on beetaversioonis
Jah, selgitava mudelina, mitte määratud struktuurina. Küsi mis tahes vestluses või ava oma biokeemia PDF ning Scholarly AI kirjutab siltidega mudeli valgu alfaheeliksitest, beetalehtedest, domeenidest või aktiivtsentrist. See on loodud valgu toimimise õpetamiseks. Mudel ei põhine eksperimentaalsetel koordinaatidel, seega kasuta PyMOL-i või ChimeraX-i, kui aatomite asukohad on olulised.
Valgu funktsioon on ruumiline ja struktuuritasemeid on loendi põhjal raske omavahel seostada. Ahel voltub heeliksiteks ja lehtedeks, need koonduvad tertsiaarstruktuuriks ning alaühikud moodustavad näiteks hemoglobiini. Ensüümi tasku või nelja heemirühma kandva alaühiku nägemine aitab mõista, miks ühes kohas toimuv muutus võib mõjutada teist kohta.
Vali just see osa, mida vajad. Palu iga aatomi asemel ühte piirkonda: ensüümi aktiivtsentrit koos substraadiga, antikeha Y-kuju koos seondumiskohtadega või membraani läbivat kanalit. Loo mudel kasutatava biokeemiapeatüki või ülevaateartikli PDF-i põhjal ning eraldi lehel avaneva mudeli sildid järgivad selle sõnastust. Võid ka lugemise ajal vestluses küsida ja mudel ilmub vestluslõime.
Tunne selle piire. Scholarly ei loe PDB- ega CIF-faile, ei kasuta eksperimentaalseid koordinaate ning ei arvuta ega ennusta struktuure. Lindid ja taskud on näitlikud, seega ära kasuta mudelit aminohappejääkide vahekauguste mõõtmiseks, dokkimiseks ega ravimidisainiks. Tegelike struktuuride jaoks kasuta PyMOL-i või ChimeraX-i koos PDB-kirjega, ennustatud struktuuri jaoks AlphaFoldi. Kasuta Scholarlyt siis, kui soovid valku klassile, õpperühmale või tiimile selgitada.
Kuidas see töötab
Kuidas luua valgumudelit
Nimeta valk, vali oluline piirkond ja kinnita loomine.
- 01
Küsi vestluses või ava oma peatükk
Palu mis tahes vestluses valgu mudelit või alusta 3D-mudelit PDF-ina salvestatud biokeemiapeatüki või ülevaateartikli põhjal. PDF-i põhjal loodud mudel avaneb eraldi lehel.
- 02
Vali, mida mudel peaks õpetama
Nimeta valk ja tunnused, millele sildid lisada: heeliksid, lehed, aktiivtsenter või domeen. Kinnita loomine, mis kasutab 1 AI-loomise krediidi.
- 03
AI joonistab ruumilise struktuuri
Mõne minutiga kirjutab see mudeli three.js-is koos lintide, siltide ja valgustusega. Kuju on näitlik, mitte koordinaatide põhjal arvutatud.
- 04
Pööra ja muuda värve
Pööra ja suumi mudelit vestlussõnumis või ava see täislehel. Palu domeeni värvi muuta ning ekspordi tasulise paketiga slaidi või video jaoks.
Kasutusvõimalused
Kus valgumudelitest abi on
Kui pead selgitama valgu toimimist, mitte seda mõõtma.
Biokeemiakursused
Valgu struktuuri neli taset, aminohappeahelast kokkupandud kompleksini.
Ensüümid
Aktiivtsenter koos substraadiga indutseeritud sobivuse ja konkureeriva inhibeerimise selgitamiseks.
Meditsiin ja füsioloogia
Hemoglobiini alaühikud ja heemirühmad või sirprakulist aneemiat põhjustav üksik muutus.
Immunoloogia
Antikeha rasked ja kerged ahelad ning antigeeni seondumiskohad.
Farmakoloogia- ja biotehnoloogiakoolitus
Retseptor või kinaas koos seondumistaskuga, et selgitada uuele töötajale toimemehhanismi.
MCAT- ja kutseeksamiteks kordamine
Struktuurid, mida pead meenutama, sinu enda kordamismaterjali sõnastust järgivate siltidega.
Proovi küsida
Valgupäringud, mida proovida
Nimeta valk ja tunnused, mida soovid esile tuua.
Loo hemoglobiin ning märgi selle neli alaühikut ja heemirühmad.
Näita alfaheeliksit ja beetalehte kõrvuti ning märgi vesiniksidemed.
Modelleeri ensüüm avatud aktiivtsentriga ja substraadiga, mis on kohe seondumas.
Loo IgG-antikeha ning märgi rasked ahelad, kerged ahelad ja antigeeni seondumiskohad.
Näita membraani läbivat G-valguga seotud retseptorit ning märgi selle seitse heeliksit.
Anna igale domeenile oma värv ja muuda taust minu slaidi jaoks läbipaistvaks.
Beeta
Mida see praegu suudab ja mida mitte
3D-mudelid on beetaversioonis. Valkude puhul tähendab see näitlikke õppemudeleid, mitte eksperimentaalsete või ennustatud koordinaatide põhjal loodud struktuure.
Praegu toimib
- Lintmudelid, millel on sildistatud alfaheeliksid, beetalehed, domeenid ja aktiivtsentrid.
- Ühe piirkonna, kompleksi või mehhanismi selgitavad vaated iga aatomi näitamise asemel.
- Luuakse mis tahes vestluses ja kuvatakse sõnumis või luuakse ühe PDF-i põhjal eraldi lehel.
- Tasulise paketiga saad eksportida 4K PNG, läbipaistva PNG, 8-sekundilise 1080p MP4-video pöörlevast mudelist või .glb-faili.
Pole toetatud
- Pole CAD-täpsusega ega sobi inseneriprojekteerimiseks. Mudelid selgitavad, kuidas miski töötab, need pole täpsete mõõtudega projektid.
- STL- ja OBJ-eksporti ning 3D-printimist ei toetata. Eksportida saab pilte, pöörleva video ja .glb-faili.
- Käsitsi 3D-töötluse tööriistu ei ole: ei saa vormida ega osi lohistada. Mudelit muudad vestluses paludes.
- Mudel luuakse ühest PDF-ist või tühjast vestlusest. Salvesta märkmed või slaidid PDF-ina või kirjelda nende sisu vestluses.
- See on beetaversioon: eelvaata iga kavandit enne rakendamist ja kontrolli silte enne mudeli meeskonnale näitamist.
KKK
Korduma kippuvad küsimused
Kas saan importida PDB- või CIF-faili?
Ei. 3D-mudeli loomine algab ühest PDF-ist või tühjast vestlusest ning see ei loe PDB-, CIF- ega muid struktuurifaile. Tegeliku PDB-kirje vaatamiseks kasuta PyMOL-i või ChimeraX-i.
Kas aminohappejääkide asukohad ja vahekaugused on täpsed?
Ei, need ei ole selleks mõeldud. Mudel ei kasuta eksperimentaalseid koordinaate ning AI paigutab heeliksid, lehed ja taskud struktuuri näitlikustamiseks. Ära kasuta seda mõõtmiseks, dokkimiseks ega disainiks.
Kas see saab ennustada valgu struktuuri järjestuse põhjal?
Ei. See ei arvuta ega ennusta voltumist. Ennustatud struktuuri jaoks kasuta AlphaFoldi ja vaata tulemust ChimeraX-is. Seejärel saab siltidega Scholarly mudel aidata selgitada selle struktuuri toimimist.
Kui üksikasjalik saab valgumudel olla?
Selgitavad mudelid on kõige arusaadavamad heeliksite, lehtede, domeenide ja alaühikute tasemel. Suure kompleksi puhul palu iga aatomi asemel ühte domeeni või seondumiskohta. Kui konkreetne külgahel on oluline, nimeta see ja palu sellele silt lisada.
Kas see saab näidata valgu kuju muutumist?
Palu seda mudeli loomisel, näiteks hemoglobiini üleminekut T- ja R-oleku vahel või ensüümi sulgumist substraadi ümber. Liikumine on idee selgitamiseks kirjutatud animatsioon, mitte molekulaardünaamika simulatsioon. Olemasolevale mudelile animatsiooni lisamine loetakse uueks loomiseks.
Kui palju valgumudel maksab?
Iga tervikliku mudeli loomine kasutab 1 AI-loomise krediidi, mille kasutamise kinnitad enne alustamist. Ebaõnnestunud loomise korral tagastatakse krediit. Sildi või domeeni värvi muutmine on väike muudatus ega kasuta krediiti. Eksportimiseks on vaja tasulist paketti.
Avasta edasi
Veel 3D-mudelite tööriistu
3D-mudelid (beeta)
Kuidas 3D-mudelid Scholarlys töötavad, sealhulgas eksportimine.
AI teaduslike 3D-mudelite generaator
Tähistega 3D-mudelid mis tahes loodusteaduslikul teemal, vestluses või PDF-i põhjal.
AI 3D-molekulimudelite generaator
Tähistega molekulimudelid õppetööks.
AI DNA 3D-mudelite generaator
Kaksikheeliks, RNA, replikatsioon ja transkriptsioon 3D-s.
AI rakkude 3D-mudelite generaator
Looma-, taime- ja bakterirakkude läbilõiked tähistatud organellidega.
AI bioloogia 3D-mudelite generaator
Neuronid, lehed ja viirused tähistega õppemudelitena.
AI anatoomia 3D-mudelite generaator
Elundid ja elundkonnad õppijatele ning kliiniliseks väljaõppeks.
AI füüsika 3D-mudelite generaator
Väljad, aatomid, orbiidid ja mehhanismid, mida saad pöörata ja suumida.
PDF-ist 3D-mudeliks
Loo PDF-is selgitatud teemast tähistega 3D-mudel.
Loo valk 3D-s
Registreeru ja nimeta valk, millega töötad, või ava oma biokeemia PDF.
Beeta. Täielik AI-ga loomine kasutab 1 AI-loomise krediiti, väikesed muudatused vestluses on tasuta. Eksportimiseks on vaja tasulist paketti.