Kurkite 3D baltymų modelius, kurie parodo, kaip struktūra lemia funkciją
Bet kuriame pokalbyje paprašykite hemoglobino, fermento ar antikūno arba atverkite biochemijos skyriaus PDF. Gausite pažymėtą modelį su išskirtomis spiralėmis, klostėmis ir aktyviuoju centru, kurį galėsite sukti ir didinti pokalbyje arba atskirame puslapyje.
Beta versija. Visam modeliui sukurti DI sunaudoja 1 DI kūrimo kreditą. Prieš tai turite patvirtinti kūrimą. Smulkūs pakeitimai pokalbyje nemokami.
Trumpas atsakymas
Ar DI gali sukurti 3D baltymo modelį?
Atnaujinta 2026 m. spalį · 3D modeliai yra beta versijos
Taip, kaip aiškinamąjį modelį, o ne nustatytą struktūrą. Paprašykite bet kuriame pokalbyje arba atverkite biochemijos PDF, ir Scholarly DI parašys pažymėtą baltymo alfa spiralių, beta klosčių, domenų ar aktyviojo centro modelį. Jis vaizduojamas tam, kad paaiškintų baltymo veikimą. Modelis nekuriamas pagal eksperimentines koordinates, todėl, kai svarbios atomų padėtys, naudokite PyMOL arba ChimeraX.
Baltymo funkcija priklauso nuo jo erdvinės struktūros, o struktūros lygius sunku susieti vien iš sąrašo. Grandinė susilanksto į spirales ir klostes, jos susijungia į tretinę struktūrą, o subvienetai sudaro tokį kompleksą kaip hemoglobinas. Matydami fermento kišenę arba keturis subvienetus, kurių kiekvienas turi hemo grupę, suprasite, kodėl pokytis vienoje vietoje gali paveikti kitą.
Pasirinkite tai, ką reikia paaiškinti. Paprašykite vienos srities, o ne kiekvieno atomo: fermento aktyviojo centro su substratu, Y formos antikūno su jungimosi vietomis arba membraną kertančio kanalo. Kurkite pagal naudojamo biochemijos skyriaus ar apžvalgos PDF, ir atskirame modelio puslapyje žymos atitiks šaltinio formuluotes. Arba paprašykite pokalbyje skaitydami, ir modelis atsiras pokalbio gijoje.
Žinokite ribas. Scholarly neskaito PDB ar CIF failų, nenaudoja eksperimentinių koordinačių ir neskaičiuoja bei neprognozuoja struktūrų. Juostos ir kišenės yra iliustracinės, todėl nenaudokite modelio atstumams tarp aminorūgščių liekanų nustatyti, molekuliniam dokingui ar vaistų projektavimui. Tikroms struktūroms naudokite PyMOL arba ChimeraX su PDB įrašu, o prognozuojamai struktūrai AlphaFold. Naudokite Scholarly, kai reikia paaiškinti baltymą klasei, mokymosi grupei ar komandai.
Kaip tai veikia
Kaip sukurti baltymo modelį
Nurodykite baltymą, pasirinkite svarbią sritį ir patvirtinkite kūrimą.
- 01
Paprašykite pokalbyje arba atverkite skyrių
Bet kuriame pokalbyje paprašykite baltymo arba pradėkite 3D modelį pagal biochemijos skyrių ar apžvalgą, išsaugotą PDF formatu. Pagal PDF sukurtas modelis atveriamas atskirame puslapyje.
- 02
Pasirinkite, ką modelis turi paaiškinti
Nurodykite baltymą ir ką pažymėti: spirales, klostes, aktyvųjį centrą ar domeną. Patvirtinkite kūrimą, kuriam naudojamas 1 DI kūrimo kreditas.
- 03
DI nupiešia susilanksčiusią struktūrą
Per kelias minutes DI parašo modelį naudodamas three.js, prideda juostas, žymas ir apšvietimą. Forma yra iliustracinė, o ne apskaičiuota pagal koordinates.
- 04
Sukite ir keiskite spalvas
Sukite modelį ir keiskite jo mastelį pokalbio žinutėje arba atverkite per visą puslapį. Paprašykite pakeisti domeno spalvą ir su mokamu planu eksportuokite skaidrei ar vaizdo įrašui.
Naudojimo būdai
Kur praverčia baltymų modeliai
Kai reikia paaiškinti baltymo veikimą, o ne jį matuoti.
Biochemijos kursai
Keturi baltymų struktūros lygiai, nuo aminorūgščių grandinės iki susidariusio komplekso.
Fermentai
Aktyvusis centras su substratu indukuoto atitikimo ir konkurencinio slopinimo paaiškinimui.
Medicina ir fiziologija
Hemoglobino subvienetai ir hemo grupės arba vienintelis pokytis, sukeliantis pjautuvinę anemiją.
Imunologija
Antikūno sunkiosios ir lengvosios grandinės bei antigeną surišančios vietos.
Farmakologijos ir biotechnologijų mokymai
Receptorius ar kinazė su jungimosi kišene veikimo mechanizmui paaiškinti naujam darbuotojui.
Pasirengimas MCAT ir profesiniams egzaminams
Struktūros, kurias reikia prisiminti, pažymėtos jūsų kartojimo medžiagos žodžiais.
Pabandykite paprašyti
Baltymų užklausos, kurias verta išbandyti
Nurodykite baltymą ir ypatybes, kurias norite išskirti.
Sukurk hemoglobiną su pažymėtais keturiais subvienetais ir hemo grupėmis.
Parodyk alfa spiralę ir beta klostę vieną šalia kitos ir pažymėk vandenilinius ryšius.
Sukurk fermento modelį su atviru aktyviuoju centru ir netrukus prisijungsiančiu substratu.
Sukurk IgG antikūną ir pažymėk sunkiąsias grandines, lengvąsias grandines bei antigeną surišančias vietas.
Parodyk membraną kertantį su G baltymu susietą receptorių ir pažymėk septynias jo spirales.
Kiekvienam domenui suteik atskirą spalvą ir padaryk foną skaidrų mano skaidrei.
Beta versija
Ką šiuo metu galima ir ko negalima padaryti
3D modeliai yra beta versijos. Baltymams tai reiškia iliustracinius mokomuosius modelius, o ne struktūras pagal eksperimentines ar prognozuojamas koordinates.
Jau veikia
- Juostiniai modeliai su pažymėtomis alfa spiralėmis, beta klostėmis, domenais ir aktyviaisiais centrais.
- Aiškinamieji vienos srities, vieno komplekso ar vieno mechanizmo vaizdai, o ne kiekvieno atomo vaizdavimas.
- Kuriamas bet kuriame pokalbyje ir rodomas žinutėje arba kuriamas pagal vieną PDF atskirame puslapyje.
- Su mokamais planais eksportuokite 4K PNG, skaidrų PNG, 8 sekundžių 1080p besisukančio modelio MP4 arba .glb failą.
Nepalaikoma
- Modeliai nėra CAD tikslumo ar inžinerinės kokybės. Jie paaiškina, kaip kas nors veikia, bet nėra tiksliais matmenimis pagrįsti projektai.
- Nėra eksporto į STL ar OBJ ir 3D spausdinimo. Galima eksportuoti vaizdus, besisukančio modelio vaizdo įrašą ir .glb failą.
- Nėra rankinio 3D redagavimo įrankių: negalima lipdyti ar vilkti dalių. Modelį keičiate pateikdami prašymus pokalbyje.
- Modelis pradedamas kurti iš vieno PDF arba tuščiame pokalbyje. Užrašus ar skaidres išsaugokite kaip PDF arba aprašykite jų turinį pokalbyje.
- Tai beta versija: prieš pritaikydami peržiūrėkite kiekvieną juodraštį, o prieš rodydami modelį komandai patikrinkite užrašus.
DUK
Dažniausiai užduodami klausimai
Ar galiu importuoti PDB arba CIF failą?
Ne. 3D modelis pradedamas nuo vieno PDF arba tuščio pokalbio ir neskaito PDB, CIF ar kitų struktūrų failų. Tikram PDB įrašui peržiūrėti naudokite PyMOL arba ChimeraX.
Ar aminorūgščių liekanų padėtys ir atstumai tikslūs?
Ne, jie tam neskirti. Modelyje nenaudojamos eksperimentinės koordinatės, o DI išdėsto spirales, klostes ir kišenes struktūrai iliustruoti. Nenaudokite jo matavimams, molekuliniam dokingui ar projektavimui.
Ar galima prognozuoti baltymo struktūrą pagal seką?
Ne. Jis neskaičiuoja ir neprognozuoja susilankstymo. Struktūrai prognozuoti naudokite AlphaFold, o rezultatą peržiūrėkite ChimeraX. Pažymėtas Scholarly modelis vėliau gali padėti paaiškinti tos struktūros veikimą.
Kiek detalus gali būti baltymo modelis?
Aiškinamieji modeliai aiškiausi spiralių, klosčių, domenų ir subvienetų lygiu. Dideliam kompleksui paprašykite vieno domeno ar vienos jungimosi vietos, o ne kiekvieno atomo. Jei svarbi konkreti šoninė grandinė, nurodykite ją ir paprašykite žymos.
Ar galima parodyti, kaip baltymas keičia formą?
Paprašykite to kurdami modelį, pavyzdžiui, parodyti hemoglobino perėjimą tarp T ir R būsenų arba fermento užsidarymą aplink substratą. Judėjimas yra idėjai paaiškinti užprogramuota animacija, o ne molekulinės dinamikos simuliacija. Animacijos pridėjimas prie esamo modelio laikomas nauju kūrimu.
Kiek kainuoja baltymo modelis?
Kiekvienam visam modeliui sukurti naudojamas 1 DI kūrimo kreditas, kurį patvirtinate iš anksto, o nepavykus sukurti modelio kreditas grąžinamas. Žymos ar domeno spalvos pakeitimas yra nedidelis pakeitimas, kuriam kredito nereikia. Eksportui reikia mokamo plano.
Atraskite daugiau
Daugiau 3D modelių įrankių
3D modeliai (beta versija)
Kaip Scholarly veikia 3D modeliai ir jų eksportas.
DI 3D gamtos mokslų modelių generatorius
3D modeliai su užrašais bet kuriai gamtos mokslų temai, kuriami pokalbyje arba iš PDF.
DI 3D molekulių modelių generatorius
Mokomieji molekulių modeliai su užrašais.
DI 3D DNR modelių generatorius
Dviguba spiralė, RNR, replikacija ir transkripcija 3D erdvėje.
DI 3D ląstelių modelių generatorius
Gyvūnų, augalų ir bakterijų ląstelių pjūviai su pažymėtomis organelėmis.
DI 3D biologijos modelių generatorius
Neuronų, lapų ir virusų mokomieji modeliai su užrašais.
DI 3D anatomijos modelių generatorius
Organai ir kūno sistemos studentams bei klinikiniam mokymui.
DI 3D fizikos modelių generatorius
Laukai, atomai, orbitos ir mechanizmai, kuriuos galite sukioti ir priartinti.
Iš PDF į 3D modelį
Sukurkite 3D modelį su užrašais pagal tai, kas paaiškinta PDF.
Sukurkite baltymą 3D formatu
Užsiregistruokite, tada nurodykite nagrinėjamą baltymą arba atverkite biochemijos PDF.
Beta versija. Visam modeliui sukurti DI sunaudoja 1 DI kūrimo kreditą, o smulkūs pakeitimai pokalbyje nemokami. Eksportui reikia mokamo plano.