简要回答
AI能制作蛋白质的3D模型吗？
2026年10月更新 · 3D模型目前为测试版
可以，不过做出来的是讲解用的模型，不是解析出的结构。在任意对话中提问，或打开你的生物化学PDF，Scholarly的AI就会编写一个带标注的模型，呈现这种蛋白质的α螺旋、β折叠、结构域或活性位点。它的目的是讲清蛋白质如何工作，并非基于实验坐标构建，因此当原子位置很重要时，请使用PyMOL或ChimeraX。
蛋白质的功能是一个三维的故事，只看列表很难把各级结构联系起来。一条肽链先形成α螺旋和β折叠，它们再堆积成三级结构，多个亚基又组装成血红蛋白这样的复合体。看到酶中的口袋，或四个各携带一个血红素基团的亚基，你就能明白为什么一处的变化会影响到另一处。
选择你需要的那部分内容。只要一个区域，不必包含所有原子：比如酶的活性位点及其底物、抗体的Y形结构及其结合位点，或穿过细胞膜的通道。用你正在学习的生物化学章节或综述PDF来构建，模型独立页面上的标签会沿用其中的措辞。也可以边读边在对话中提问，模型会直接出现在对话中。
也要清楚它不是什么。Scholarly不读取PDB或CIF文件，不使用实验坐标，也不计算或预测结构。带状结构和口袋都是示意性的，因此不要用模型来判断残基距离、做分子对接或药物设计。如需真实结构，请用PyMOL或ChimeraX打开PDB条目；如需预测结构，请使用AlphaFold。当你要向班级、学习小组或团队讲解一种蛋白质时，就用Scholarly。
使用方式
如何构建蛋白质模型
说出蛋白质名称，选择重要的区域，然后确认构建。
- 01
在对话中提问或打开章节
在任意对话中要一个蛋白质模型，或从保存为PDF的生物化学章节或综述开始创建3D模型。基于PDF的模型会在独立页面中打开。
- 02
选择模型要讲解的内容
说明是哪种蛋白质，以及要标注哪些特征：螺旋、折叠、活性位点或某个结构域。确认构建，这会使用1个AI创作积分。
- 03
AI绘制折叠结构
几分钟内，它会用three.js写出模型，包含带状结构、标签和光照。形状是示意性的，并非根据坐标计算得出。
- 04
旋转并重新着色
在对话消息中旋转和缩放，或全页打开。只需提出要求就能给结构域重新着色；使用付费套餐还可以导出用于幻灯片或视频。
使用场景
蛋白质模型能帮上忙的场景
适合需要讲清蛋白质的作用，而不是测量它的时候。
生物化学课程
蛋白质的四级结构，从氨基酸链到组装完成的复合体。
酶
活性位点及其底物，用于讲解诱导契合和竞争性抑制。
医学与生理学
血红蛋白的亚基和血红素基团，或导致镰状细胞病的那一处改变。
免疫学
抗体的重链、轻链及其抗原结合位点。
药理学与生物技术培训
带结合口袋的受体或激酶，用来向新员工讲解作用机制。
MCAT和专业资格考试复习
需要记住的结构，并用你自己复习资料中的措辞来标注。
试着这样问
可以试试这些蛋白质请求
说出蛋白质名称和你想标出的特征。
构建血红蛋白，并标注它的四个亚基和血红素基团。
并排展示α螺旋和β折叠，并标注氢键。
为一种酶建模，活性位点处于打开状态，底物即将结合。
构建IgG抗体，并标注重链、轻链和抗原结合位点。
展示一个穿过细胞膜的G蛋白偶联受体，并标注它的七个螺旋。
给每个结构域分别上色，并把背景设为透明，我要放到幻灯片里。
测试版
目前能做什么，不能做什么
3D模型目前是测试版。对蛋白质来说，这意味着它们是示意性的教学模型，不是根据实验坐标或预测坐标得出的结构。
目前支持
- 带状模型，可标注α螺旋、β折叠、结构域和活性位点。
- 针对单个区域、单个复合体或单一机制的讲解视图，而不是呈现所有原子。
- 可在任意对话中构建并显示在消息中，也可基于一个PDF构建并在独立页面中查看。
- 付费套餐可导出4K PNG、透明背景PNG、8秒1080p转台动画MP4或.glb文件。
暂不支持
- 不具备CAD精度，也达不到工程级标准。模型用于解释事物如何运作，而不是经过测量的设计图。
- 不支持导出STL或OBJ，也不支持3D打印。可导出图片、转台视频和.glb文件。
- 没有手动3D编辑工具：不能雕刻，也不能拖动部件。要修改模型，直接在对话中提出即可。
- 模型可以从一个PDF或一个空白对话开始。如果是笔记或幻灯片，请先另存为PDF，或在对话中描述内容。
- 这是测试版功能：应用每份草稿前请先预览，在向团队展示模型前请检查标注。
常见问题
常见问题
可以导入PDB或CIF文件吗？
不可以。3D模型从一个PDF或一个空白对话开始，不会读取PDB、CIF或其他结构文件。要查看真实的PDB条目，请使用PyMOL或ChimeraX。
残基的位置和距离准确吗？
不准确，模型也不追求这一点。模型不使用实验坐标，AI排布螺旋、折叠和口袋是为了说明结构。请不要把它用于测量、分子对接或设计。
能根据序列预测蛋白质结构吗？
不能。它不会计算或预测折叠。如需预测结构，请使用AlphaFold，并在ChimeraX中查看结果。之后可以用带标注的Scholarly模型来讲解该结构的作用。
蛋白质模型可以做到多详细？
讲解用的模型在螺旋、折叠、结构域和亚基这一层级最清晰。对于大型复合体，请只要求一个结构域或一个结合位点，不必包含所有原子。如果某条侧链很重要，请点名并要求添加标签。
能展示蛋白质的构象变化吗？
可以在构建时提出，例如血红蛋白在T态和R态之间转换，或酶闭合包住底物。这种运动是为讲解概念而编写的动画，不是分子动力学模拟。为现有模型添加动画算作一次新的构建。
蛋白质模型怎么收费？
每次完整构建使用1个AI创作积分，构建前会先请你确认；构建失败会退还积分。修改标签或结构域颜色属于小幅编辑，不消耗积分。导出需要付费套餐。
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